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在腫瘤免疫***研發(fā)方面,液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)為篩選高親和力、高特異性的T細(xì)胞受體或CAR結(jié)構(gòu)提供了強(qiáng)大工具。通過(guò)將候選T細(xì)胞與表面展示有特定**抗原的靶細(xì)胞共同包裹在同一個(gè)液滴內(nèi),可以創(chuàng)建一個(gè)微型的“免疫突觸”模擬環(huán)境。利用延時(shí)活細(xì)胞成像或終點(diǎn)熒光檢測(cè)技術(shù),可以精確識(shí)別出哪些液滴中發(fā)生了有效的腫瘤細(xì)胞殺傷事件。隨后,系統(tǒng)能夠自動(dòng)分選出這些液滴中的效應(yīng)T細(xì)胞,用于后續(xù)的擴(kuò)增和深度測(cè)序分析。這種方法能夠直接從龐大的天然或人工突變T細(xì)胞庫(kù)中,篩選出具有***潛力的稀有克隆,加速新型過(guò)繼性細(xì)胞免疫療法的開發(fā)進(jìn)程,并有助于探索針對(duì)實(shí)體瘤的更有效靶點(diǎn)。液滴微反應(yīng)器為研究細(xì)胞凋亡、分裂等生命進(jìn)程提供了大量平行觀察窗口。中國(guó)臺(tái)灣突變庫(kù)液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)

細(xì)胞命運(yùn)的決策,如分裂、分化、衰老或死亡,即使在遺傳背景相同的克隆群體中也存在明顯的隨機(jī)異質(zhì)性。液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)作為一個(gè)超高通量的單細(xì)胞培養(yǎng)與長(zhǎng)期活細(xì)胞成像平臺(tái),使得同步追蹤成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的整個(gè)生命歷程成為可能。通過(guò)分析這些海量的單細(xì)胞行為軌跡數(shù)據(jù),可以構(gòu)建出精細(xì)的細(xì)胞命運(yùn)決策圖譜,定量揭示內(nèi)在基因表達(dá)噪聲、代謝波動(dòng)與外在微環(huán)境信號(hào)如何共同決定一個(gè)細(xì)胞的歸宿。這對(duì)于深刻理解胚胎發(fā)育和組織穩(wěn)態(tài)等基本生物學(xué)過(guò)程中的細(xì)胞異質(zhì)性機(jī)制具有至關(guān)重要的意義。
突變庫(kù)液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)該系統(tǒng)廣泛應(yīng)用于合成生物學(xué),用于評(píng)估遺傳電路功能及構(gòu)建人工細(xì)胞群落。

液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)能夠用于從頭理性設(shè)計(jì)和構(gòu)建人工合成微生物群落。研究人員可以按照預(yù)設(shè)的物種比例與空間排列,將不同代謝功能分工的工程菌株精確地共封裝在液滴中,形成一個(gè)簡(jiǎn)化的、可控的合成生態(tài)系統(tǒng)。通過(guò)設(shè)計(jì)菌株間的代謝互養(yǎng)網(wǎng)絡(luò),并利用液滴系統(tǒng)高通量地優(yōu)化菌株組合、比例及環(huán)境參數(shù),可以創(chuàng)建出高效協(xié)同、穩(wěn)健性強(qiáng)的生物制造系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)比單一菌株更為復(fù)雜的化學(xué)物質(zhì)合成與降解任務(wù),為環(huán)境修復(fù)、綠色化工及智能療法開發(fā)開辟了新路徑。
微生物在自然環(huán)境中的絕大部分都處于營(yíng)養(yǎng)匱乏的休眠狀態(tài)或緩慢生長(zhǎng)狀態(tài),這是傳統(tǒng)培養(yǎng)方法失敗的主要原因之一。液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)通過(guò)模擬這種低營(yíng)養(yǎng)通量的寡營(yíng)養(yǎng)環(huán)境,為喚醒這些“沉默的大多數(shù)”提供了可能。與傳統(tǒng)使用富營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基不同,基于液滴的培養(yǎng)可以采用稀釋數(shù)百甚至數(shù)千倍的低濃度營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),或者直接使用過(guò)濾除菌的環(huán)境水樣(如海水、湖水、土壤浸出液)作為培養(yǎng)基。這種寡營(yíng)養(yǎng)條件避免了高速生長(zhǎng)帶來(lái)的毒性物質(zhì)積累和氧化應(yīng)激,更符合大多數(shù)微生物的原生境,從而能夠誘導(dǎo)那些在富營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基中無(wú)法啟動(dòng)生長(zhǎng)的微生物進(jìn)行分裂繁殖。同時(shí),液滴的微尺度效應(yīng)本身也可能有利于微生物生長(zhǎng),例如它增加了細(xì)胞與營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)及自身分泌的生長(zhǎng)因子的局部濃度,可能觸發(fā)了群體感應(yīng)或自刺激性生長(zhǎng)。研究人員可以將環(huán)境樣品進(jìn)行高度稀釋后封裝,確保大量液滴中只含有一個(gè)微生物細(xì)胞,并在溫和的條件下進(jìn)行長(zhǎng)期培養(yǎng)(數(shù)周甚至數(shù)月)。通過(guò)定期監(jiān)測(cè)液滴的濁度、熒光(來(lái)自活細(xì)胞染料)或代謝活性,可以識(shí)別出那些雖然生長(zhǎng)緩慢但能夠形成微菌落的液滴。這種方法極大地?cái)U(kuò)展了可培養(yǎng)微生物的范圍,特別是對(duì)于那些占據(jù)環(huán)境微生物主體、但此前一直未被認(rèn)識(shí)的稀有物種或候選門級(jí)類群。 在海洋微生物學(xué)中,該技術(shù)助力開發(fā)了模擬深海條件的原位培養(yǎng)新策略。

微流控技術(shù)作為單細(xì)胞操控的工具,在全自動(dòng)單克隆挑取系統(tǒng)中正引發(fā)新一輪的進(jìn)步。傳統(tǒng)有限稀釋法步驟繁瑣、效率低下且克隆性難以保證,而基于微滴微流控的“單細(xì)胞-微滴”包裹策略則完美解決了這些痛點(diǎn)。該系統(tǒng)通過(guò)精密設(shè)計(jì)的芯片通道將細(xì)胞懸液與油相流體混合,在剪切力作用下生成數(shù)以萬(wàn)計(jì)的微升級(jí)液滴,每個(gè)液滴理論上至多包裹一個(gè)目標(biāo)細(xì)胞,形成單獨(dú)的納升甚至皮升級(jí)生物反應(yīng)器。這種物理隔離環(huán)境不僅徹底避免了細(xì)胞間的交叉污染,還為后續(xù)克隆性驗(yàn)證提供了無(wú)可辯駁的證據(jù)——因?yàn)槊總€(gè)克隆群體都明確源自一個(gè)被隔離的祖細(xì)胞。全自動(dòng)平臺(tái)的集成進(jìn)一步放大了其優(yōu)勢(shì):高速成像系統(tǒng)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)液滴生成與細(xì)胞包裹狀態(tài),機(jī)械臂或電場(chǎng)驅(qū)動(dòng)實(shí)現(xiàn)液滴的精確分選與轉(zhuǎn)移,將含有單細(xì)胞的液滴定向接種至96孔板或其它培養(yǎng)載體。整個(gè)過(guò)程在密閉無(wú)菌條件下完成,極大地降低了外源污染風(fēng)險(xiǎn),同時(shí)將挑取通量提升至每小時(shí)數(shù)千克隆的水平。這對(duì)于需要大規(guī)模篩選的抗體藥物開發(fā)、工程細(xì)胞株構(gòu)建等應(yīng)用場(chǎng)景而言,意味著研發(fā)周期的大幅縮短與候選分子多樣性的極大豐富。更重要的是,液滴培養(yǎng)的均一性確保了克隆群體在發(fā)育初期處于高度一致的微環(huán)境,為后續(xù)功能研究提供了可靠的比較基礎(chǔ)。 液滴培養(yǎng)組學(xué)是連接單細(xì)胞基因組學(xué)與微生物組功能研究的重要橋梁技術(shù)。中國(guó)臺(tái)灣突變庫(kù)液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)
液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)整合了培養(yǎng)、檢測(cè)與分選,實(shí)現(xiàn)了全流程的自動(dòng)化與微型化。中國(guó)臺(tái)灣突變庫(kù)液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)
干細(xì)胞生物學(xué)研究的關(guān)鍵挑戰(zhàn)在于精確控制其自我更新與定向分化。液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)可以用于大規(guī)模篩選能夠維持干細(xì)胞多能性、或誘導(dǎo)其高效、均一地分化為特定功能細(xì)胞類型的培養(yǎng)條件、細(xì)胞因子組合及小分子化合物。將干細(xì)胞分散到液滴中,并施加成千上萬(wàn)種不同的誘導(dǎo)條件,進(jìn)而通過(guò)檢測(cè)特異性干性標(biāo)志物或譜系分化標(biāo)志物的表達(dá)來(lái)評(píng)估效果。這種超高通量的篩選能力能夠加速干細(xì)胞在疾病建模、藥物篩選和細(xì)胞替代療法等再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的轉(zhuǎn)化應(yīng)用。中國(guó)臺(tái)灣突變庫(kù)液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)
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